Installation de GeoNature-citizen

Prérequis

Application développée et installée sur un serveur Debian 9.

Ce serveur doit aussi disposer de :

  • sudo (apt-get install sudo)
  • un utilisateur (monuser dans cette documentation) appartenant au groupe sudo (pour pouvoir bénéficier des droits d’administrateur)

1. Créer un utilisateur Debian :

adduser nom_utilisateur (geonatadmin) entrez un mot de passe (****)
usermod -aG sudo nom_utilisateur (geonatadmin)
su - nom_utilisateur (geonatadmin)

2. Vérifier que l’utilisateur est correctement créé :

sudo -l (entrez un mot de passe) : vérifier que ALL
sudo whoami : ok si on peut faire un sudo

3. Changer la locale en fr (il faut être root) :

sudo dpkg-reconfigure locales

INSTALLATION Automatique

notes:
  • Bien vérifier de ne pas être en root :
su - nom_utilisateur (geonatadmin)
  • S’assurer d’avoir le projet Geonature-citizen dans ce dossier ainsi que d’etre propriétaire du dossier et de ses dépendances
  • Se rendre sur la Home de votre utilisateur
cd

Lancer le script d’installation :

./install/install_app.sh
  • Le script créera un fichier de config settings.ini, il faut alors le compléter avec les informations de votre installation.
editor ./config/settings.ini
  • Complétez également les fichiers de config Apache situés dans config/apache
  • Relancer le script :
./install/install_app.sh

Le script crééra la base de données, configurera taxhub si l’installation est demandée, configurera apache et installera toutes les dépendances du projet Geonature-Citizen.

INSTALLATION DE TAXHUB

Pour plus de détails, lien officiel pour l’installation de TaxHub : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/

Configurer le serveur : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/serveur.html#installation-et-configuration-du-serveur

Configurer PostgreSQL : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/serveur.html#installation-et-configuration-de-posgresql

Configuration et installation de l’application : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/installation.html

notes:
  • Bien vérifier de ne pas être en root :
su - nom_utilisateur (geonatadmin)
  • Pour avoir les caractéristiques de votre instance :
lsb_release -a
uname -a

INSTALLATION DE GEONATURE-CITIZEN

Etape 1 : Configurer PostgreSQL :

notes: 
sudo sh -c 'echo "deb http://apt.postgresql.org/pub/repos/apt/ stretch-pgdg main" >>/etc/apt/sources.list.d/postgresql.list'
sudo wget --quiet -O - https://www.postgresql.org/media/keys/ACCC4CF8.asc | sudo apt-key add
sudo apt update
sudo apt install postgresql-10 postgresql-10-postgis-2.5 postgresql-10-postgis-2.5-scripts git
sudo -u postgres createuser -e -E -P dbuser (geonatadmin) (Entrez le password)
sudo -u postgres createdb -e -E UTF8 -O dbuser (geonatadmin) dbname (geonature2db)
notes:
  • ls /etc/init.d/ : pour lister les services
  • sudo service restart postgresql : vérification

Etape 2 : Installer python3, pip et virtualenv :

python3 -m pip install --upgrade --user virtualenv
sudo apt install python3-pip

installer virtualenv :

export PATH=/home/username/.local/bin:$PATH (username = geonatadmin)
echo $PATH
virtualenv -p /usr/bin/python3 venv
source venv/bin/activate

Etape 3 : Installation du backend et de la base des données :

notes:

Cloner le dépôt Github de GeoNature-citizen

sudo apt install git
git clone name (citizen)
git checkout branch_name
cd citizen/backend

Création du référentiel des géométries communales :

wget https://github.com/PnX-SI/GeoNature/raw/master/data/core/public.sql -P /tmp
wget https://github.com/PnX-SI/GeoNature/raw/master/data/core/ref_geo.sql -P /tmp
wget https://github.com/PnX-SI/GeoNature/raw/master/data/core/ref_geo_municipalities.sql -P /tmp

psql -d geonature2db -h localhost -p 5432 -U geonatadmin -f /tmp/public.sql
sed 's/MYLOCALSRID/2154/g' /tmp/ref_geo.sql > /tmp/ref_geo_2154.sql
psql -d geonature2db -h localhost -p 5432 -U geonatadmin -f /tmp/ref_geo_2154.sql

Pour restaurer en cas de besoin :

psql -d geonature2db -h localhost -U geonatadmin -f ~/citizen_taxhub_l_areas_dump.sql
if [ ! -f '/tmp/communes_fr_admin_express_2019-01.zip' ]
then
   wget  --cache=off http://geonature.fr/data/ign/communes_fr_admin_express_2019-01.zip -P /tmp
else
   echo "/tmp/communes_fr_admin_express_2019-01.zip already exist"
fi
unzip /tmp/communes_fr_admin_express_2019-01.zip -d /tmp/
psql -d geonature2db -h localhost -p 5432 -U geonatadmin -f /tmp/fr_municipalities.sql
psql -d geonature2db -h localhost -p 5432 -U geonatadmin -c "ALTER TABLE ref_geo.temp_fr_municipalities
OWNER TO geonatadmin;"
psql -d geonature2db -h localhost -p 5432 -U geonatadmin -f /tmp/ref_geo_municipalities.sql
psql -d geonature2db -h localhost -p 5432 -U geonatadmin -c "DROP TABLE ref_geo.temp_fr_municipalities;"

Lancement du backend pour générer les schémas :

En mode debug :

export FLASK_ENV=development; export FLASK_DEBUG=1; export FLASK_RUN_PORT=5002; export FLASK_APP=wsgi;
python -m flask run --host=0.0.0.0

Enregistrement du module principal :

insert into gnc_core.t_modules values (1, 'main', 'main', 'main', NULL, false, '2019-05-26 09:38:39.389933', '2019-05-26 09:38:39.389933');

Enregistrement d’un programme exemple

psql -d geonature2db -h localhost -p 5432 -U geonatadmin -c "INSERT INTO gnc_core.t_programs VALUES (1, 'Au 68', 'inventaire  du 68', 'desc', NULL,    NULL,   1,      1,      't', '0106000020E6100000010000000103000000010000000500000001000070947C154042CA401665A5454001000070EE7C15402235D7E667A54540010000D81C7D1540AFBA27365AA5454000000040C47C1540DD9BD74A58A5454001000070947C154042CA401665A54540',    '2019-05-26 09:38:39.389933', '2019-05-26 09:38:39.389933');"

Etape 4 : éditer le fichier de config :

notes: 
cd ../config
editer les paramètres dans config.toml

-SQLALCHEMY_DATABASE_URI :"postgresql+psycopg2://dbuser(geonatadmin):password(***)@127.0.0.1:5432/dbname(geonature2db)"
-URL_APPLICATION : 'https://ipserveur:4200/'
-API_ENDPOINT : 'https://ipserveur:5002/api'
-API_TAXHUB : 'http://ipserveur/taxhub/api/'

- Pour configurer du serveur Smtp renseigner les différents paramètres de votre serveur
dans la partie [MAIL] ( MAIL_HOST,MAIL_PORT ..)
 # La partie [RESET_PASSWD] correspond à la configuration du texte du mail a envoyé pour la restauration
  du mot de passe oublié
 # La partie [CONFIRM_EMAIL] correspond à la configuration du texte du mail a envoyé pour l’activation
 du compte et la confirmation de l’adresse mail de l’utilisateur

Etape 5 : configuration des badges :

Etape 6 : configuration du supervisor :

/etc/supervisor/conf.d/geonature-citizen-service.conf
[program:citizen]
command = /home/geonatadmin/citizen/backend/start_gunicorn.sh
autostart=true
autorestart=true
stdout_logfile = /var/log/supervisor/citizen.log
redirect_stderr = true

Etape 7 : Installation du frontend :

notes: 
cd citizen/frontend/
nvm use --lts  # Now using node v10.16.0 (npm v6.9.0)
si pas installé : nvm install --lts (remplacer lts par la dernière version)
cp -v src/assets/badges_* ../media/

Editer la conf :

cp src/conf*.ts.sample src/conf/  # ajuster la conf
# copier le template css alternatif
cp src/custom/custom.css.template src/custom/custom.css
# Pour configurer le lien externe de la fiche détaillée de l'espèce, éditer l'entrée suivante:
details_espece_url: "<url_inpn_or_atlas>/cd_nom/" // !! garder bien le cd_nom/ dans l'url

Lancer le front :

npm run build:i18n-ssr && npm run serve:ssr